二戰(zhàn)后殖民地國家紛紛尋求獨立，盧旺達統(tǒng)治階級也希望擺脫比利時的托管，實現(xiàn)完全的自由。 比利時不能逆勢而上，但它也不想利用圖西精英，為了自身利益最大化，比利時轉(zhuǎn)而全力支持胡圖族。 短短幾年時間胡圖人就翻身了，1960年比利時支持盧旺達舉行大選。 結(jié)果，占人口多數(shù)的胡圖族自然而然地擊敗了圖西族，從而奪取了政權(quán)和軍隊。

胡圖人上臺后，圖西人立即被清算。 大批圖西族精英逃往鄰國避難，而留在盧旺達的圖西族則成為壓迫的對象。 因此雖然胡圖族和圖西族的地位發(fā)生了逆轉(zhuǎn)，但兩個族群之間的矛盾依然存在，而且越來越尖銳。
逃離盧旺達的圖西精英在烏干達建立了“盧旺達愛國陣線”。 他們多次組織軍隊反擊盧旺達，想從胡圖人手中奪回政權(quán)。 盧旺達胡圖族也因政治不和、爭權(quán)奪利而產(chǎn)生矛盾，導致胡圖族統(tǒng)治形勢不斷惡化。

1973年，胡圖族溫和派領(lǐng)袖哈比亞利馬納發(fā)動政變奪取政權(quán)。 在20多年的執(zhí)政生涯中，哈比亞利馬納一直在努力緩和胡圖族與圖西族之間的矛盾，尋求兩者共存的途徑。 然而胡圖族的強硬派，主要是年輕人，并不買賬。 他們大聲宣揚兩族之間的仇恨，甚至號召胡圖族拿起武器，將圖西族全部殺光，這為隨后的盧旺達種族滅絕奠定了基礎(chǔ)。

1994年4月6日，盧旺達總統(tǒng)哈比亞利馬納和布隆迪總統(tǒng)恩塔里亞米拉在坦桑尼亞會晤后同機飛往盧旺達。 然而這架飛機在盧旺達首都基加利附近被擊落，兩位總統(tǒng)同時遇難。
墜機當天，胡圖族強硬派聲稱是圖西人，4月7日，胡圖族士兵沖進總理府，殺死了圖西族女總理和三名部長，悲劇性的盧旺達大屠殺就這樣開始了。